本分署轄區包括跨省市河川淡水河、磺溪及鶯歌溪、塔寮坑溪、深澳坑溪、大內坑溪四條中央管區域排水，與新北市及基隆市沿岸海堤整建、治理、管理，另尚辦理轄區水文調查、觀測及分析業務。
員山子分洪道是位於臺灣新北市瑞芳區的水利設施，以隧道方式銜接基隆河瑞芳河段與東海。
基隆河是位於臺灣北部的河川，也是淡水河三大上游支流之一，全長86.4公里，橫跨新北市、基隆市與臺北市。