概要：
本局依「經濟部水利署各河川局組織通則」規定於民國九十一年三月二十八日成立，置局長一人，綜理局務，並監督所屬員工，置副局長一人襄理局務，置秘書一人，協助局長處理行政業務，並設規劃、工務、管理、資產四課辦理各該掌業務，設秘書、主計、人事、政風四室分別掌理各該室業務。
掌理事項：
規劃課：水文及規劃基本資料之測驗、調查及其資料統計分析、管理與河川排水及海堤治理計畫之規劃事項。
工務課：工程之勘測、設計、工務行政及監工事項。
管理課：河川、排水、海堤管理、河川海堤區域之勘測、違法違規行為之預防與取締處罰等事項。
資產課：工程用地取得及資訊相關業務。
秘書室：掌理研考、文書、印信、出納、庶務議事，公共關係，為民服務及其他不屬於各課室事項。
主計室：依法辦理歲計，會計及統計事項。
人事室：依法辦理人事管理事項。
政風室：依法辦理政風事項。
編制：
本局編制員額六十四人，駐衛警察十人，技工六人，工友三人，駕駛三人。