淡水河流域內行政區域包括臺北市、新北市、桃園縣、基隆市、新竹縣及宜蘭縣，其中大臺北都會區（臺北市、新北市）為我國政經中心所在。歷年來已實施「臺北地區防洪計畫」、「基隆河整體治理計畫（前期計畫）」等政策，有效提升臺北地區防洪能力。
其中大台北防洪計畫為保護包括台北市全部及新北市的三重、蘆洲、五股、泰山、新莊、板橋、土城、中和、永和等市鄉鎮，即「台北盆地」區內11,857公頃土地，650萬人民生命財產安全，自71年開始進行，於85年完成，總計興建堤防60公里、水門39座、疏洪道1座；排水幹線49公里及鴨母港、四汴頭等抽水站29座；並改建台北橋、華江橋及浮洲橋，新建二重疏洪道橋及103線、108線及越堤疏洪道橋3座。本計畫完成後，使台北地區可獲得200年頻率防洪保護標準及改善排水系統，並保留大片濕地維持更佳的生態保育環境。
基隆河早年沿岸每逢豪雨必成災，民國76年琳恩颱風及82年提姆、87年瑞伯和芭比絲颱風接連造成災害，行政院於民國87年即指示加速「基隆河治理工程初期實施計畫」，初期以保護10年重現期距洪峰流量為標準興建護岸，分三期施工完成防洪計畫，完成初期治理後，水利署動員所屬8個河川局人力，克服用地取得困難等不利因素，與時間賽跑，在民國93年12月底完成整體治理，合計完成護堤長度兩岸達49公里，並提供基隆市約30公頃、臺北市及新北市約37公頃河川綠帶休憩空間，總保護面積達1,029公頃。
員山子分洪道位於基隆河上游瑞芳瑞柑新村旁，採用工法就是於該地開鑿出一條內徑12公尺，長2.5公里的分洪隧道，是全東南亞最大的分洪道，在200年頻率洪水來臨時，可將上游81%的洪水，直接排放入東海。平日不分洪時，則維持河道的自然流量，以保護下游生態。值得一提的是，員山子分洪道入口是採用無人控制，水到達一定高度，自然溢流至分洪隧道，可避免人為失誤。