磺溪流域地理位置位於臺灣北部，屬新北市金山區，以及臺北市北投區及士林區等行政區域，流域面積約50.8平方公里，週邊有淡水河流域、以及老梅溪及員潭溪流域，上游集水區主要為陽明山國家公園範圍，下游流域面臨東海。磺溪發源於大屯火山群七星山北麓，主要流向為西南朝向東北方，三和橋以上河道蜿蜒於山谷之中，而自三和橋出山谷後河幅漸寬，再流經南勢、下六股，於社寮地區與來自西北向之支流清水溪及西勢溪匯流後流入東海，長度約13.75公里。本流域上游大致保持原始林相，而三和橋以下河川周邊土地利用以農耕為主，人口主要集中在下游右岸濱海區域之社寮、金山、磺港等地區，交通以省道台2線、台2甲線公路為主。